عمده‌ترین اهداف این پژوهشکده عبارتند از:
- هماهنگی با اهداف وزارت علوم، تحقیقات وفن‌آوری
- ایجاد هماهنگی هر چه بیشتر بین جنبه‌های نظری و تحقیقاتی در روش های جغرافیا واشاعه جغرافیای کاربردی
- مطالعه جامعه جغرافیایی کشور و مشارکت فعال جغرافیدانان و یاری‌رساندن به مسئولین و برنامه ریزان
مهم‌ترین وظایف پژوهشکده علوم جغرافیایی و برنامه ریزی عبارتند از:
- انجام طرح های مطالعاتی مورد سفارش دستگاههای اجرایی و بخش خصوصی
- اجرای طرحهای تحقیقاتی به منظورشناسایی علمی و عملی کشور در جهت بهره برداری بهینه از آنها در زمینه اجرایی و برنامه ریزی‌با عنایت ویژه به مناطق محروم
- جمع آوری و خرید مدارک، کتب، نقشه‌ها، تصاویر جغرافیایی،وسایل آزمایشگاهی و بهره‌گیری از آنها در انجام مطالعات جغرافیائی
- ایجاد دوره‌های آموزشی‌کوتاه مدت، تشکیل سمینارها، کنفرانسها و سخنرانیهای علمی داخلی و خارجی
- چاپ و نشرکتب و مجلات و تنظیم سفرهای علمی در راستای ارتقاء دانش جغرافیا و جغرافیای کاربردی.
مطالعه امکان سنجی توسعه فعالیتها، تولیدات و ایجاد فرصت های شغلی در سامانه های عشایری(گل افشان)
طرح جامع مدیریت بحران شهرهای استان چهارمحال و بختیاری
برآورد پیش بینی سیلاب ها در استان چهارمحال و بختیاری
ارزیابی پتانسیل باد در پهنه باد خیز ایران
تحلیل روند خشکسالی های اقلیمی حوضه های آبی در نیم سده گذشته
بررسی نقش فناوری اطلاعات و ارتباطات در کاهش تقاضای سفرهای شهری
مطالعات امکان سنجی ۱۵ منطقه نمونه گردشگری استان اصفهان
تهیه طرح هادی روستاهای دوراهان و ده توت از توابع شهرستان بروجن
انجام مطالعه و پژوهش در منظر فرهنگی کوه آتشگاه اصفهان
مدیریت بحران و پدافند غیر عامل در محور فرهنگی بازار
مهندسی رودخانه خرم آباد بر اساس شاخص های ژئومرفیک( از محل تک شبیخون تا چم انجیر)
تهیه طرح هادی روستای تجک از توابع شهرستان بشاگرد